與一般嬰兒奶粉比較，母乳有下列的優點：
一、母乳含有從母體而來的各種抗體，可以幫助寶寶對抗外界侵入體內的一些病毒及細菌，就好像媽媽把自己曾經對抗傳染性疾病的累積經驗傳承給寶寶。
其傳承途徑有兩條：
1、出生前主要由臍帶血液中的特殊免疫球蛋白不斷傳輸給子宮內的寶寶；
2、出生后，因臍帶已脫落，此時主要由媽媽的乳汁不斷傳輸給寶寶，所以吃母乳的寶寶較吃奶粉的寶寶具有抵抗力，其道理就在于此。
二、寶寶在出生后的頭幾個月中，自己的防御能力尚未健全，易受病媒的侵犯，母乳剛好可以提供這方面的支援。但是這種支援是有限的，并非萬無一失的，因為：
1、母嬰存在個體差異性。
如果母體本身對目前周圍流行的病媒都沒有抗御能力的話，更何況已在母體外獨立生活的寶寶呢?
2、腸胃以外部位受惠較少。
喂食母乳是直接進入寶寶的胃腸，所以其胃腸方面的抵抗力會較佳，即不易腹瀉、嘔吐；但是在呼吸系統上的抵抗力則較弱。所以在嬰幼兒的成長階段，難免尚會有鼻塞、咳嗽、氣管炎、甚至肺炎等情況發生。
3、抗體減少。
寶寶約到四五個月后，其體內來自母體血液傳輸的抗體明顯減少，而單純依賴母乳中的抗體也不足以應付外界層出不窮的病媒，所以生病次數自然會增加了。
4、非傳染性的疾病。
許多嬰幼兒的疾病如咳嗽、鼻塞，可能與先天鼻腔的構造較狹窄及對環境的過敏有關，是眾多因素相互作用下導致的癥狀。比如：寶寶尿道發炎可能與先天的腎臟及泌尿系統畸形有關；肺炎、氣管炎可能是未被大人注意到的嗆奶引起的刺激反應；腹瀉、腸炎可能與飲食過敏有關；吐奶、溢奶則與胃敏感度有關，等等。
因此，“吃母乳的寶寶較不易生病”只是在統計學上比較的結果，但是如果隨意找出幾個寶寶來互相比較，則差異就不那么明顯了，所以不能認為“吃母乳的寶寶不是永不生病”的。
另外，每個父母對寶寶癥狀的敏感度不同，有些父母太敏感了，只要寶寶打個噴嚏或吐一次奶，就認為寶寶生病了，急急忙忙就抱去找醫生開藥吃，或有時在醫生面前描述的癥狀有可能夸大了些。有關病情的描述主要是以父母陳述為依據，而醫生處方藥物以針對癥狀為主，夸大的描述易使醫生誤診，因此明明原是個健康的寶寶，也可能因為父母過于敏感，而做了一些不必要的檢查或多吃了不少的藥。