免疫接種可以增強人體的免疫力，預防傳染病的發生，但為了防止和減少預防接種副反應的發生，各種疫苗都規定了患有某種疾病或處于某種特殊生理狀況的人，不宜接種的禁忌癥。大致說來，疫苗接種的禁忌癥可分為以下兩類。
第一類，一般禁忌癥。是指不適用于一般疫苗接種的禁忌癥，如婦女妊娠期;某種傳染病流行時(如乙腦流行時)不宜進行百日咳疫苗的接種;既往患過某種傳染病獲得免疫者，近期內可不予接種相應的疫苗；6周內進行過被動免疫者，應推遲活疫苗的接種；發熱、特別是高熱的人不適合各種疫苗接種；急性傳染病的潛伏期、前驅期、發病期及恢復期，重癥慢性患者(如活動性肺結核、心臟代償功能不全、急慢性腎臟病變、糖尿病、高血壓、肝硬化、血液系統疾患、活動性風濕病、嚴重化膿性皮膚病)等，均應暫緩各種接種。對有過敏性體質的人、對患神經系統疾病的人、精神病患者以及1歲以下兒童有嚴重營養不良者，接種疫苗時應特別慎重。
第二類，特殊禁忌癥。是指某種疫苗所規定的專門禁忌癥。麻疹疫苗、卡介苗和脊髓灰質炎糖丸疫苗的禁忌癥：凡患有免疫缺陷病、白血病、淋巴瘤、惡性腫瘤以及因各種因素使免疫功能受到抑制者，均不能接種；結核菌素試驗陽性者，不宜接種卡介苗；錫克試驗陰性者，不需接種白喉疫苗;腎炎患者及既往有神經系統疾患或腦病史者，不能用百白破混合疫苗;接種百白破混合制劑出現嚴重的接種反應，發熱虛脫、休克、抽搐、體溫超過40.5℃或其他神經系統癥狀后，下次則停用百白破，而只注射白喉及破傷風類毒素(二聯制劑)；患有濕疹、化膿性中耳炎或有嚴重皮膚病者，不能接種卡介苗；腹瀉嬰幼兒、一日大便超過4次以上者，不宜服用小兒麻痹糖丸；兒童嚴重腹瀉，可在疾病康復后，服用脊髓灰質炎糖丸疫苗。
正確掌握禁忌癥，既是減少接種副反應和事故的重要措施，也是使每一個應接種者得到免疫的保證。陳教授指出，醫生和家長應認真掌握，密切配合。尤其是兒童家長，要把兒童的健康情況如實地向計劃免疫機構和醫生反映，以便醫生根據具體情況，確定是否進行預防接種，特別是有營養不良和體弱的兒童，容易受到疾病的威脅，更需要對他們進行免疫保護。有些家長由于怕孩子打針痛或出現接種反應，就以接種禁忌癥為借口，不愿意讓孩子接種疫苗，這是不正確的。