奶瓶中的奶極易受到污染，容易誘發腹瀉、發熱等問題，而奶瓶消毒則是避免這一直接污染的最佳途徑。在給奶瓶消毒之前，一定要給它認真地“洗次澡”，用奶瓶刷把奶瓶中殘留的污垢洗干凈。否則，無論怎樣消毒，一樣會給奶瓶留下衛生“死角”。
給奶瓶消毒最常用的是煮沸法。將水煮沸，然后先把奶瓶放入其中，煮沸10分鐘；再將奶嘴放入沸水中，煮5分鐘左右，撈出晾干。之所以如此分開，是因為奶嘴用橡膠或硅膠制成，耐熱時間很短，久了易軟化，甚至釋放有毒物質。此外，還可用微波爐消毒。將清洗后的奶瓶盛上清水放入微波爐，打開高火10分鐘即可。但要注意，千萬不能將奶嘴及連接蓋放入微波爐，以免變形、損壞。塑料奶瓶用蒸氣消毒法更安全。
寶寶抵抗力弱，腸胃易被感染。因此6個月之前的孩子，每次必須使用消毒過的奶瓶。因此，家里有條件的最好備4—6個奶瓶。另外，塑料奶瓶如經常消毒，易釋放有毒的化學物質，最好3個月換一個。