嬰幼兒最好不用或少用紫藥水。因為使用不當時可出現毒副作用，小兒可表現為煩躁不安、易激怒、哭鬧、夜寐不寧、周圍皮膚潮紅、瘙癢或皮疹等。
英國衛生部門對紫藥水的使用范圍和包裝說明已作了新規定。規定中將紫藥水的使用范圍縮小到只能用于局部未破損的皮膚。而且嚴禁內服，嚴禁涂抹于口腔、肛門、尿路等黏膜處或破損的皮膚傷口上，以防誘發癌癥。雖然國內還未發現有人因涂抹紫藥水而致癌，但用量需嚴格掌握。