患傳染病后正處于恢復期或有急性傳染病接觸史而又未過檢疫期的兒童不宜打預防針。若此時打預防針容易發生不良反應，或使原有病情加重。
正在患感冒或因各種疾病引起發熱的兒童，若打預防針，會使體溫升高，誘發或加重疾病。
有哮喘、濕疹、蕁麻疹及過敏性體質的兒童，打預防針后容易產生過敏反應，特別是打麻疹活疫苗，或致敏原較強的預防針，更易產生過敏反應；對有癲癇和驚厥史的兒童打預防針，尤其注射了乙腦或混合制劑后，容易使兒童發生暈厥、抽風和休克等。
患急慢性腎臟病、活動性肺結核、嚴重心臟病、化膿性皮膚病、化膿性中耳炎的兒童，打預防針后會出現各種不良反應，加重原有的病情。
預防接種期間，若兒童正處于不舒服，不嘔吐、腹瀉和咳嗽等癥狀時，應暫時不打預防針，待癥狀好轉后再補打。