初乳強過益生菌
很多新媽媽自認為是一個純母乳喂養的媽媽，但在寶寶出生后的頭幾天都加過配方奶，很多寶寶第一口奶吃的就是配方奶，而這樣恰恰喪失了媽媽將免疫力輸送給寶寶的珍貴機會。
母乳喂養對寶寶的先天免疫有重要影響，對母乳的研究顯示，媽媽乳腺內產生乳汁的小體周圍會看到細菌，這個細菌是媽媽在生寶寶之前就準備好的。
因為媽媽在生孩子之前的二三十年間寄存在乳管有很多菌群，這些菌群在寶寶出生后通過正常的母乳喂養可輸送給寶寶，這些最初的乳汁有助于新生兒建立平衡的免疫系統，而不是寄希望于給孩子服用益生菌。
很多人提倡給寶寶吃益生菌增強免疫力，或者因為各種原因造成寶寶的“第一口奶”是配方奶，這就使得媽媽乳腺小體乳管內為寶寶準備好的細菌被輕易放棄。
母乳喂養是有菌過程
很多人認為乳房上會有細菌，因此在喂奶前把乳房擦得非常干凈；還有人認為剛開始的乳汁比較臟，所以要擠出幾滴乳汁以后再哺乳……而這些媽媽極力追求的“無菌環境”恰恰不利于寶寶的免疫系統。
目前的嬰兒有兩類免疫系統疾病很常見：過敏性疾病和肥胖，它們都與腸道菌群不健康或發育異常有關。很多媽媽害怕細菌接觸到寶寶，其實細菌需要與人共存，母乳喂養就是先給寶寶喂細菌再喂乳汁，寶寶一出生并非需要保持在無菌環境中生存，無菌反而會給寶寶帶來麻煩。
適當的清潔是必要的，但新媽媽要認識到：母乳是非常干凈的營養液體，但干凈不代表沒有細菌，母乳喂養不是無菌喂養過程，而是有菌喂養過程。建議直接喂養母乳，不需要過度消毒，更不需要加溫。不提倡在喂奶前先將乳頭擦洗得過于干凈，因為孩子在吮吸時，可以適當吃到媽媽乳頭及乳頭周圍皮膚上和乳管內的細菌，有利于嬰兒腸道健康。
還要注意的是，配方奶的喂養就屬于無菌操作，因為奶瓶和奶嘴使用之前都會高溫消毒，而喂養方式中也不會引入細菌，因此雖然配方奶企業都會在奶粉中加入活性菌成分，但也遠遠達不到與母乳喂養相同的水平。
頻繁使用消毒劑不可取
寶寶免疫性疾病的增多，除了與母乳喂養不到位有關，還與環境中消毒劑的使用有關，例如媽媽要慎重對待頻繁消毒乳房的行為。
細菌對免疫功能的發育起著至關重要的作用，如果寶寶平時不接觸細菌、周圍的環境太干凈，腸道就無法發育成熟。想要維持寶寶正常的腸道功能，應讓寶寶適量接觸細菌，少菌而非無菌的生活環境很重要。當年的“非典”使得本該在醫院或大型公共場所中才能使用的消毒劑大量進入家庭，而這些消毒劑會破壞腸道細菌。
因此建議家庭應停止濫用化學消毒劑或消毒成分，特別是要避免慢性消毒劑的食入，例如媽媽消毒乳房所使用的慢性消毒劑可能會被孩子食用，而導致腸道內的細菌平衡被打亂，引起免疫功能受損。過量過濫使用消毒劑，除了降低腸道免疫力之外，還可能會引起過敏性鼻炎、咳嗽、流鼻涕、哮喘、過敏性結膜炎等疾病。